Agoniste bağlı insan kanabinoid reseptörü CB1’in kristal yapıları
Mechoulam, R., Hanuš, LO, Pertwee, R. & Howlett, AC Erken fitokanabinoid kimyasından endokannabinoidlere ve ötesine. Nat. Rahip Neurosci. 15757–764 (2014).
Hua, T. ve ark. İnsan kanabinoid reseptörü CB1'in kristal yapısı. Hücre 167750–762 (2016).
Ballesteros, JA & Weinstein, H. in Sinir Bilimlerinde Yöntemler Cilt 25 (ed. Sealfon SC) 366–428 (Akademik, 1995).
Lemberger, L. Esrarın potansiyel terapötik faydası. Annu. Rev. Pharmacol. Toksikol. 20151–172 (1980).
Li, H.-L. Çin'deki esrarın arkeolojik ve tarihi bir açıklaması. Ekon. Bot. 28437–448 (1973).
Makriyannis, A. 2012 Tıbbi Kimya Bölümü Ödül Konuşması. Kanabinoid yolda yürüyüş: kişisel bir bakış açısı. J.Med. Kimya 573891–3911 (2014).
Shao, Z. ve diğerleri. İnsan CB1 kanabinoid reseptörünün yüksek çözünürlüklü kristal yapısı. Doğa 540602–606 (2016).
Nikas, SP ve ark. Klasik kannabinoidlerde halojen ikamesinin rolü: bir CB1 farmakofor modeli. AAPS J. 6e30 (2004).
Nikas, SP ve ark. Yeni 1',1'-zincirli ikame edilmiş heksahidrokanabinoller: 9β-hidroksi-3-(1-heksil-siklobut-1-il)-heksahidrokanabinol (AM2389) oldukça güçlü bir kannabinoid reseptörü 1 (CB)1) agonisti. J.Med. Kimya 536996–7010 (2010).
Xie, XQ, Melvin, LS & Makriyannis, A. Yüksek derecede seçici kanabinoid reseptör ligandı CP-55,940'ın konformasyonel özellikleri. J. Biol. Kimya 27110640–10647 (1996).
Makriyannis, A. & Rapaka, RS Kannabinoidlerin tıbbi kimyası: genel bakış. NIDA Arş. Monogr. 79204–210 (1987).
Ahn, KH, Bertalovitz, AC, Mierke, DF & Kendall, DA Kannabinoid reseptörü 1'in ikinci hücre dışı halkasının ikili rolü: ligand bağlanması ve reseptör lokalizasyonu. Mol. Farmakol. 76833–842 (2009).
Feigenbaum, JJ ve diğerleri. Psikotropik olmayan kannabinoid, fonksiyonel bir N-metil-D-aspartat reseptör blokeri. Proc. Natl Acad. Bilim. Amerika 869584–9587 (1989).
Mechoulam, R. ve diğerleri. Enantiyomerik kanabinoidler: psikotropik aktivitenin stereospesifikliği. Deneyim 44762–764 (1988).
Hanson, MA ve ark. Bir lipit G proteinine bağlı reseptörün kristal yapısı. Bilim 335851–855 (2012).
Rasmussen, SG ve ark. β'nın kristal yapısı2 adrenerjik reseptör-Gs protein kompleksi. Doğa 477549–555 (2011).
Singh, R. ve diğerleri. Kanabinoid CB1 reseptörünün aktivasyonu, bir W6.48/F3.36 rotamer geçiş anahtarını içerebilir. J. Pept. Hiçbir şey 60357–370 (2002).
Tiburu, EK ve ark. Membran taklitçi ortamlarda insan kanabinoid reseptörü-2 sarmal 6'nın yapısal biyolojisi. Biyokimya. Biyofiz. Res. İletişim 384243–248 (2009).
Zhang, K. ve diğerleri. İnsan P'nin yapısı2YAntitrombotik bir ilaçla kompleks halinde 12 reseptörü. Doğa 509115–118 (2014).
Zhang, J. ve diğerleri. İnsan P'sinin agoniste bağlı yapısı2Y12 reseptör. Doğa 509119–122 (2014).
Nikas, SP ve ark. (-)-Δ9-tetrahidrokannabinol ve (-)-Δ9-tetrahidrokannabivarin metabolitlerinin ve bunların bölgesel olarak döteryumlanmış analoglarının sentezi için kısa bir metodoloji. dörtyüzlü 638112–8113 (2007).
Kulkarni, S. ve ark. Yeni C-halkası-hidroksi ile ikame edilmiş kontrollü deaktivasyon kanabinerjik analogları. J.Med. Kimya 596903–6919 (2016).
D'Antona, AM, Ahn, KH & Kendall, DA CB1 T210'un mutasyonları aktif ve inaktif reseptör formları üretir: ligand afinitesi, reseptör stabilitesi ve hücresel lokalizasyon ile korelasyonlar. Biyokimya 455606–5617 (2006).
Caffrey, M. & Cherezov, V. Lipidik mezofazlar kullanılarak membran proteinlerinin kristalleştirilmesi. Nat. Protokoller 4706–731 (2009).
Cherezov, V. ve diğerleri. İnsan membran proteinlerinin mikrokristal örneklerinin 10 μm'nin altındaki bir X-ışını senkrotron ışınıyla taranması ve merkezlenmesi için tarama stratejisi. JR Soc. Arayüz 6S587–S597 (2009).
Chun, E. ve diğerleri. G proteinine bağlı reseptörlerin stabilizasyonu ve kristalizasyonu için füzyon ortağı araç kutusu. Yapı 20967–976 (2012).
Kabsch, W.XDS. Acta Crystallogr. D 66125–132 (2010).
McCoy, AJ ve ark. Phaser kristalografik yazılımı. J. Başvuru. Crystallogr. 40658–674 (2007).
Adams, PD ve ark. PHENIX: makromoleküler yapı çözümü için kapsamlı Python tabanlı bir sistem. Acta Crystallogr. D 66213–221 (2010).
Akıllı, OS ve ark. İyileştirmede yapı benzerliğinden yararlanma: BUSTER'da otomatik NCS ve hedef yapı kısıtlamaları. Acta Crystallogr. D 68368–380 (2012).
Emsley, P., Lohkamp, B., Scott, WG & Cowtan, K. Coot'un özellikleri ve gelişimi. Acta Crystallogr. D 66486–501 (2010).
Friesner, RA ve ark. Glide: hızlı, doğru yerleştirme ve puanlama için yeni bir yaklaşım. 1. Yerleştirme doğruluğunun yöntemi ve değerlendirilmesi. J.Med. Kimya 471739–1749 (2004).
Friesner, RA ve ark. Ekstra hassas kayma: protein-ligand kompleksleri için hidrofobik muhafaza modelini içeren yerleştirme ve puanlama. J.Med. Kimya 496177–6196 (2006).
Halgren, TA ve ark. Glide: hızlı, doğru yerleştirme ve puanlama için yeni bir yaklaşım. 2. Veri tabanı taramasında zenginleştirme faktörleri. J.Med. Kimya 471750–1759 (2004).
Xu, T. ve diğerleri. Uyarılmış uyum yerleştirme, homoloji modellerinde doğru serbest enerji pertürbasyon hesaplamalarına olanak tanır. J. Chem. Teorik Hesaplama. 185710–5724 (2022).
Abraham, MJ ve ark. GROMACS: dizüstü bilgisayarlardan süper bilgisayarlara kadar çok seviyeli paralellik yoluyla yüksek performanslı moleküler simülasyonlar. YazılımX 1–219–25 (2015).
Pettersen, EF ve ark. UCSF Chimera—keşifsel araştırma ve analize yönelik bir görselleştirme sistemi. J. Bilgisayar. Kimya 251605–1612 (2004).
Sousa da Silva, AW & Vranken, WF ACPYPE—AnteChamber PYthon Ayrıştırıcı arayüzü. BMC Res. Notlar 5367 (2012).
Berman, HM ve ark. Protein Veri Bankası. Çekirdek Asitler Res. 28235–242 (2000).
Skjærven, L., Yao, XQ, Scarabelli, G. & Grant, BJ Protein yapısal dinamiklerini ve evrimsel analizi Bio3D ile entegre etmek. BMC Biyoinf. 15399 (2014).