Suda tioester aracılı RNA aminoasilasyonu ve peptidil-RNA sentezi

Kadın, WAS ve Ibba, M. Sentetazlar. RNA 26910–936 (2020).

Madde
CAS

Weber, AL ve Lacey, JC Bir adenilat anhidritten poliribonükleotitlere aminoasil transferi. J. Mol. Evrim. 6309–320 (1975).

Google Akademik

Weber, AL ve Orgel, LE Adenosin 5′-fosforimidazolid ile amino asit aktivasyonu. J. Mol. Evrim. 119–16 (1978).

Radakoviç, A. ve ark. Peptit sentezindeki rolünden önce RNA aminoasilasyonunun potansiyel bir rolü. Proc. Natl Acad. Bilim. Amerika 121e2410206121 (2024).

Madde
CAS
PubMed
PubMed Merkezi
REKLAMLAR

Spiegelman, S., Haruna, I., Holland, IB, Beaudreau, G. & Mills, D. Kendi kendine çoğalan ve bulaşıcı bir nükleik asidin saflaştırılmış bir enzimle sentezi. Proc. Natl Acad. Bilim. Amerika 54919–927 (1965).

Bartel, DP & Szostak, JW Rastgele dizilerden oluşan geniş bir havuzdan yeni ribozimlerin izolasyonu. Bilim 2611411–1418 (1993).

Madde
CAS
PubMed
PubMed Merkezi
REKLAMLAR

Voytek, SB & Joyce, GF Sürekli evrim geçirme kapasitesine sahip, hızlı reaksiyona giren bir ribozimin ortaya çıkışı. Proc. Natl Acad. Bilim. Amerika 10415288–15293 (2007).

Ichihashi, N. ve diğerleri. Hücre benzeri bir bölme içinde çeviri ile eşleşmiş bir RNA replikasyon sisteminde Darwinci evrim. Nat. Yaygın. 42494 (2013).

Madde
PubMed
REKLAMLAR

Lee, DH, Granja, JR, Martinez, JA, Severin, K. & Ghadiri, MR Kendi kendini kopyalayan bir peptit. Doğa 382525–528 (1996).

Madde
PubMed
PubMed Merkezi
REKLAMLAR

Rout, SK, Friedmann, MP, Riek, R. & Greenwald, J. Amiloidlere dayanan prebiyotik şablona yönelik bir peptit sentezi. Nat. Yaygın. 9234 (2018).

Breaker, RR & Joyce, GF RNA ve DNA fonksiyonunun genişleyen görünümü. Kimya Biyol. 211059–1065 (2014).

Tümra, K. ve Schimmel, P. Bilim 3051253–1253 (2004).

Wu, L.-F., Su, M., Liu, Z., Bjork, SJ & Sutherland, JD Bir tRNA alıcı kök sarkıntı taklitinde iplikler arası aminoasil transferi. J. Am. Kimya Sos. 14311836–11842 (2021).

Turk, RM, Illangasekare, M. & Yarus, M. Ribozim riboz üzerinde katalize edilmiş ve spontan reaksiyonlar. J. Am. Kimya Sos. 1336044–6050 (2011).

Biron, J.-P., Parkes, AL, Pascal, R. & Sutherland, JD Nükleotidlerin hızlı, potansiyel olarak ilkel aminoasilasyonu. Angew. Kimya Uluslararası Ed. 446731–6734 (2005).

Madde
CAS

Shannon, CE Matematiksel bir iletişim teorisi. Bell Sistem. Teknik. J. 27379–423 (1948).

Madde
MathSciNet

De Duve, C. in Yaşamın Moleküler Kökenleri: Yapbozun Parçalarının Birleştirilmesi (ed. Brack, A.) 219–236 (Cambridge Univ. Press, 1998).

Goldford, JE, Hartman, H., Smith, TF & Segrè, D. Fosfatsız eski bir metabolizmanın kalıntıları. Hücre 1681126–1134 (2017).

Fairchild, J., Islam, S., Singh, J., Bučar, DK & Powner, MW Suda prebiyotik açıdan makul kemoseçici pantetein sentezi. Bilim 383911–918 (2024).

Gless, BH, Schmied, SH, Bejder, BS & Olsen, CA Biyokimyada ve doğal kimyasal ligasyonda tiyoesterlerin reaktivitesinin araştırılmasına yönelik Förster rezonans enerji transferi deneyi. JACS Au 31443–1451 (2023).

Weber, AL ve Orgel, LE Glisin tioesterlerden peptitlerin oluşumu. J. Mol. Evrim. 13193–202 (1979).

Thoma, B. & Powner, MW Lizin peptidlerinin seçici sentezi ve su içinde katalitik olarak aktif diaminopropiyonik asit peptid nitrillerinin prebiyotik açıdan makul sentezi. J. Am. Kimya Sos. 1453121–3130 (2023).

Canavelli, P., Islam, S. & Powner, MW Suda kemoselektif aminonitril bağlanmasıyla peptid ligasyonu. Doğa 571546–549 (2019).

Ninomiya, K., Minohata, T., Nishimura, M. ve Sisido, M. Bir peptit nükleik asidine bağlı amino asit tiyoesterleri ile yerinde kimyasal aminoasilasyon. J. Am. Kimya Sos. 12615984–15989 (2004).

Li, N. ve Huang, F. CoA tiyoesterlerinden ribozim katalizli aminoasilasyon. Biyokimya 444582–4590 (2005).

Attwater, J., Wochner, A. & Holliger, P. RNA polimeraz ribozim aktivitesinin buz içi evrimi. Nat. Kimya 51011–1018 (2013).

Merino, EJ, Wilkinson, KA, Coughlan, JL & Weeks, seçici 2′-hidroksil asilasyon ve primer uzantısı (SHAPE) ile tek nükleotid çözünürlüğünde KM RNA yapı analizi. J. Am. Kimya Sos. 1274223–4231 (2005).

Fang, L., Xiao, L., Jun, YW, Onishi, Y. & Kool, ET Tersinir 2′-OH asilasyonu, RNA stabilitesini arttırır. Nat. Kimya 151296–1305 (2023).

Yarus, M. RNA’dan oluşan spesifik bir amino asit bağlanma bölgesi. Bilim 2401751–1758 (1988).

Burd, GC & Dreyfuss, G. RNA bağlayıcı proteinlerin korunmuş yapıları ve fonksiyon çeşitliliği. Bilim 265615–621 (1994).

Aumiller, W. & Keating, C. Hücre içi sıvı organellere yönelik bir model olarak fosforilasyon aracılı RNA/peptit kompleksi koaservasyonu. Nat. Kimya 8129–137 (2016).

Deng, M., Yu, J. ve Blackmond, DG Prebiyotik ligasyon reaksiyonlarında simetri kırılması ve kiral amplifikasyon. Doğa 6261019–1024 (2024).

Takvim, R. & Berg, P. D-tirosil RNA: protein sentezi için oluşumu, hidrolizi ve kullanımı. J. Mol. Biyol. 2639–54 (1967).

Madde
PubMed
PubMed Merkezi

Pawar, KI ve ark. AlaRS tarafından glisin yanlış şarjına karşı hücresel savunma olarak kiral düzeltmenin ötesinde D-aminoasil-tRNA deaçilazın rolü. e-Hayat 6e24001 (2017).

Hadjichristidis, N., Iatrous, H., Pitsikalis, M. & Sakellariou, G. a-amino asidin halka açma polimerizasyonu yoluyla iyi tanımlanmış polipeptit bazlı malzemelerin sentezi N-karboksianhidritler. Kimya Rev. 1095528–5578 (2009).

Foden, CS ve ark. Nötr suda peptid ligasyonunu katalize eden sistein peptidlerinin prebiyotik sentezi. Bilim 370865–869 (2020).

Singh, J. ve diğerleri. Prebiyotik katalitik peptit ligasyonu, nötr suda bölge seçici lizin ligasyonunu kolaylaştıran molekül içi amid katalizli hidroliz yoluyla proteinojenik peptitler verir. J. Am. Kimya Sos. 14410151–10155 (2022).

Barat, A. & Powner, MW Sisteaminin aracılık ettiği spontan peptit ligasyonu. JACS Au 41752–1757 (2024).

Chaturvedi, RK, MacMahon, AE & Schmir, GL Tiyoimidat esterlerin hidrolizi. Tetrahedral ara ürünler ve genel asit katalizi. J. Am. Kimya Sos. 896984–6993 (1967).

Madde
CAS

Van den Berg, L. Karşılıklı sisteme sodyum ve potasyum klorür eklenmesinin etkisi: KH₂PO₄-İşte bu₂HPO₄-H₂Dondurma sırasında pH ve bileşim üzerinde O. Arch. Biyokimya. Biyofiz. 84305–315 (1959).

Madde
PubMed

Jash, B., Tremmel, P., Jovanovic, D. & Richert, C. Ribozomsuz tek nükleotid çevirisi. Nat. Kimya 13751–757 (2021).

Reußwig, SG & Richert, C. RNA dizileri üzerinde şablon yürüyüşü yoluyla pentapeptitlere kadar ribozom içermeyen çeviri. Angew. Kimya Uluslararası Ed. 63e202410317 (2024).

Madde

Toner, JD & Catling, DC Yaşamın kökenindeki fosfat sorununa karbonat açısından zengin bir göl çözümü. Proc. Natl Acad. Bilim. Amerika 117883–888 (2020).